Beskattningen vid koncernbidrag styrs av särskilda regler i inkomstskattelagen som anger när ett koncernbidrag är avdragsgillt respektive skattepliktigt. För att givaren ska få avdrag för koncernbidraget krävs att samtliga villkor för koncernbidrag enligt lagstiftningen är uppfyllda, exempelvis att det finns ett kvalificerat ägarförhållande, att båda bolagen är skattskyldiga i Sverige och att bidraget är öppet redovisat i deklarationerna. Om förutsättningarna inte är uppfyllda kan avdraget nekas, samtidigt som mottagaren ändå kan behöva ta upp beloppet till beskattning, vilket leder till en ogynnsam skatteeffekt.

Mottagaren beskattas som huvudregel för koncernbidraget som en vanlig intäkt. På koncernnivå blir effekten att vinst och förlust kan flyttas mellan bolag, så att den totala skatten bättre speglar koncernens samlade resultat. I planeringen av koncernbidrag behöver hänsyn tas till bland annat underskottsavdrag, begränsningsregler, tidigare års resultat och eventuella förändringar i ägarstrukturen. Ett genomtänkt arbetssätt innebär därför inte bara att uppfylla formella krav, utan också att löpande analysera hur koncernbidrag påverkar resultat, nyckeltal, balansposter och framtida skattepositioner i både enskilda bolag och på koncernnivå.